自然资源局是省以下垂直管理，但是由于自然资源局工作特性，离不开当地部门协同管理，因为自然资源局是原来的国土资源管理局，林业局，海洋渔业局合并组建的一个新局，无论是国土资源管理还是林业执法，渔业发展都离不开当地指导，所以也接受当地管理。